El endostilo es un surco ciliado longitudinal que se encuentra en la pared ventral de la faringe de los urocordados, cefalocordados y las larvas de las lampreas. Está formada por glándulas mucosas y recubierta por tejido conjuntivo y cartilaginoso. Produce una mucosidad que atrapa partículas de alimento, ayudando en el transporte del alimento hacia el esófago.[1] Es una estructura homóloga de la glándula tiroides.[2]
Presenta células relacionadas con el metabolismo del iodo (formación de compuestos iodados). En las larvas de las lampreas se metamorfosea en la glándula tiroides, al convertirse estas en adultos, y se la considera como un homólogo de la tiroides de los vertebrados.[1] Sin embargo la homología entre el endostilo de las lampreas y el de los urocordados y cefalocorrdados ha sido cuestionada.[3]
Dado que se encuentra en tres ramas de cordados, se presume que surgió en un ancestro común de estos taxones, en conjunto con un cambio en el método de alimentación a uno interno de extracción de partículas de alimento suspendidas en el agua.[4]